Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SREBF2Q12772 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SREBF2Q12772 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SREBF2Q12772 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SREBF2Q12772 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SREBF2Q12772 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SREBF2Q12772 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SREBF2Q12772 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SREBF2Q12772 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SREBF2Q12772 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SREBF2Q12772 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
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