Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCBP1Q09161 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCBP1Q09161 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP1Q09161 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCBP1Q09161 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCBP1Q09161 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms