Protein–RNA interactions for Protein: Q04602

VBA4, Vacuolar basic amino acid transporter 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4Q04602 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 SLM3YDL033C 1254 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 RIB1YBL033C 1038 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 YPL108WYPL108W 507 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 SOD2YHR008C 702 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 NPL6YMR091C 1308 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 CHS7YHR142W 951 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 YIR035CYIR035C 765 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 YMR166CYMR166C 1107 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 SGV1YPR161C 1974 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 EHD3YDR036C 1503 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 LSP1YPL004C 1026 nt7.16□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 TMS1YDR105C 1422 nt7.16□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 snR86snR86 1004 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 BUR6YER159C 429 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 OLA1YBR025C 1185 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA4Q04602 YJL009WYJL009W 327 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 YJR149WYJR149W 1215 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 AIM34YMR003W 597 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 YOR300WYOR300W 309 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 YEN1YER041W 2280 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 CIR2YOR356W 1896 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 MET22YOL064C 1074 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 YPL071CYPL071C 471 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 LAS17YOR181W 1902 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 CAK1YFL029C 1107 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 ERG6YML008C 1152 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 BUB2YMR055C 921 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 PMT7YDR307W 1989 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 OCH1YGL038C 1443 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 ABP1YCR088W 1779 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 CMK2YOL016C 1344 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 YCR049CYCR049C 447 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 COX16YJL003W 357 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 RRT14YIL127C 621 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 YJL160CYJL160C 864 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 SRN2YLR119W 642 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 HIS3YOR202W 663 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 PDC6YGR087C 1692 nt7.09□□□□□ -1.27
VBA4Q04602 HOS2YGL194C 1359 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 ITR1YDR497C 1755 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 YHR145CYHR145C 357 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 RNA170RNA170 169 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 AST1YBL069W 1290 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 CCR4YAL021C 2514 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 PRC1YMR297W 1599 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 YBR056WYBR056W 1506 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 CHA1YCL064C 1083 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 YPL264CYPL264C 1062 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 NDE2YDL085W 1638 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 PET18YCR020C 648 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 YHC3YJL059W 1227 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 SCO2YBR024W 906 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 HEL1YKR017C 1656 nt7.05□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 BAP3YDR046C 1815 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 YPT31YER031C 672 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 MEP1YGR121C 1479 nt7.04□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 NDE1YMR145C 1683 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 SPE4YLR146C 903 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 ATP10YLR393W 840 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 RHO1YPR165W 630 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 BEM1YBR200W 1656 nt7.03□□□□□ -1.28
VBA4Q04602 MFT1YML062C 1179 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YPR084WYPR084W 1371 nt7.02□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 THI73YLR004C 1572 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 RBS1YDL189W 1374 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 TIF3YPR163C 1311 nt7.01□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 TOP3YLR234W 1971 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YER156CYER156C 1017 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YMR147WYMR147W 672 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YMR206WYMR206W 942 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YNL140CYNL140C 570 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 RPS6AYPL090C 711 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 RPS6BYBR181C 711 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 SNU71YGR013W 1863 nt7□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 GRH1YDR517W 1119 nt6.99□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 BXI1YNL305C 894 nt6.99□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 WSC4YHL028W 1818 nt6.99□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 PUP3YER094C 618 nt6.98□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt6.98□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 OCA1YNL099C 717 nt6.98□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 HXT9YJL219W 1704 nt6.98□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 GGC1YDL198C 903 nt6.97□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 UTR5YEL035C 501 nt6.97□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 ASN2YGR124W 1719 nt6.97□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 YER152CYER152C 1332 nt6.97□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 SIR2YDL042C 1689 nt6.96□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 EHT1YBR177C 1356 nt6.96□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 CKI1YLR133W 1749 nt6.96□□□□□ -1.29
VBA4Q04602 APM1YPL259C 1428 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 RRT6YGL146C 936 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 ORM1YGR038W 669 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 FRT1YOR324C 1809 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 ERR3YMR323W 1314 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 ERR1YOR393W 1314 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 ERR2YPL281C 1314 nt6.96□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 YOS9YDR057W 1629 nt6.95□□□□□ -1.3
VBA4Q04602 SHC1YER096W 1539 nt6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms