Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF9Q00978 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF9Q00978 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRF9Q00978 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms