Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP6V0D1P61421 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V0D1P61421 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V0D1P61421 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V0D1P61421 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V0D1P61421 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V0D1P61421 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V0D1P61421 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V0D1P61421 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms