Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH15P55291 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH15P55291 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH15P55291 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH15P55291 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH15P55291 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH15P55291 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH15P55291 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH15P55291 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH15P55291 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH15P55291 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH15P55291 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH15P55291 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH15P55291 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH15P55291 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH15P55291 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH15P55291 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH15P55291 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH15P55291 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH15P55291 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH15P55291 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH15P55291 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH15P55291 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH15P55291 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH15P55291 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH15P55291 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH15P55291 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH15P55291 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH15P55291 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH15P55291 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH15P55291 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH15P55291 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH15P55291 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH15P55291 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH15P55291 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH15P55291 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH15P55291 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH15P55291 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH15P55291 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH15P55291 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH15P55291 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH15P55291 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH15P55291 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH15P55291 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH15P55291 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH15P55291 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH15P55291 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH15P55291 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH15P55291 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH15P55291 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH15P55291 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH15P55291 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH15P55291 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH15P55291 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH15P55291 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH15P55291 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH15P55291 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH15P55291 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH15P55291 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH15P55291 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH15P55291 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH15P55291 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH15P55291 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH15P55291 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH15P55291 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH15P55291 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms