Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRISP3P54108 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRISP3P54108 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRISP3P54108 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms