Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB1P53618 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB1P53618 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB1P53618 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPB1P53618 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COPB1P53618 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB1P53618 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB1P53618 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB1P53618 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB1P53618 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPB1P53618 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB1P53618 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB1P53618 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB1P53618 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPB1P53618 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COPB1P53618 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB1P53618 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB1P53618 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB1P53618 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB1P53618 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPB1P53618 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB1P53618 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB1P53618 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB1P53618 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB1P53618 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COPB1P53618 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB1P53618 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB1P53618 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB1P53618 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB1P53618 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPB1P53618 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB1P53618 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB1P53618 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPB1P53618 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COPB1P53618 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COPB1P53618 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB1P53618 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB1P53618 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB1P53618 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COPB1P53618 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPB1P53618 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COPB1P53618 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COPB1P53618 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB1P53618 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB1P53618 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPB1P53618 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COPB1P53618 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COPB1P53618 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COPB1P53618 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COPB1P53618 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB1P53618 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB1P53618 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB1P53618 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB1P53618 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COPB1P53618 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB1P53618 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB1P53618 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB1P53618 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB1P53618 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB1P53618 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB1P53618 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB1P53618 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB1P53618 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPB1P53618 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPB1P53618 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB1P53618 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB1P53618 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB1P53618 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB1P53618 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB1P53618 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB1P53618 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB1P53618 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB1P53618 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB1P53618 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB1P53618 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB1P53618 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB1P53618 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB1P53618 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB1P53618 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB1P53618 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB1P53618 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB1P53618 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB1P53618 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB1P53618 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB1P53618 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB1P53618 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB1P53618 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPB1P53618 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPB1P53618 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPB1P53618 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPB1P53618 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPB1P53618 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPB1P53618 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPB1P53618 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms