Protein–RNA interactions for Protein: P53297

PBP1, PAB1-binding protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PBP1P53297 VBA3YCL069W 1377 nt7.46□□□□□ -1.21
PBP1P53297 MET1YKR069W 1782 nt7.46□□□□□ -1.21
PBP1P53297 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 YLR280CYLR280C 351 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 YMR265CYMR265C 1386 nt7.46□□□□□ -1.22
PBP1P53297 YGR210CYGR210C 1236 nt7.45□□□□□ -1.22
PBP1P53297 BUD20YLR074C 501 nt7.45□□□□□ -1.22
PBP1P53297 HAP5YOR358W 729 nt7.45□□□□□ -1.22
PBP1P53297 GDA1YEL042W 1557 nt7.45□□□□□ -1.22
PBP1P53297 AGP3YFL055W 1677 nt7.44□□□□□ -1.22
PBP1P53297 BEM1YBR200W 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
PBP1P53297 RPN14YGL004C 1254 nt7.44□□□□□ -1.22
PBP1P53297 LSR1LSR1 1175 nt7.44□□□□□ -1.22
PBP1P53297 SIR2YDL042C 1689 nt7.44□□□□□ -1.22
PBP1P53297 DUS3YLR401C 2007 nt7.44□□□□□ -1.22
PBP1P53297 POX1YGL205W 2247 nt7.43□□□□□ -1.22
PBP1P53297 SRP54YPR088C 1626 nt7.43□□□□□ -1.22
PBP1P53297 GGC1YDL198C 903 nt7.43□□□□□ -1.22
PBP1P53297 YKL053WYKL053W 375 nt7.43□□□□□ -1.22
PBP1P53297 FCY1YPR062W 477 nt7.43□□□□□ -1.22
PBP1P53297 RIM2YBR192W 1134 nt7.42□□□□□ -1.22
PBP1P53297 YCR049CYCR049C 447 nt7.41□□□□□ -1.22
PBP1P53297 MRS3YJL133W 945 nt7.41□□□□□ -1.22
PBP1P53297 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.41□□□□□ -1.22
PBP1P53297 CRC1YOR100C 984 nt7.41□□□□□ -1.22
PBP1P53297 SNX3YOR357C 489 nt7.41□□□□□ -1.22
PBP1P53297 PMA2YPL036W 2844 nt7.41□□□□□ -1.22
PBP1P53297 RPC31YNL151C 756 nt7.4□□□□□ -1.22
PBP1P53297 CTF3YLR381W 2202 nt7.39□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YPT11YNL304W 1254 nt7.39□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YPL108WYPL108W 507 nt7.39□□□□□ -1.23
PBP1P53297 NDJ1YOL104C 1059 nt7.38□□□□□ -1.23
PBP1P53297 SAN1YDR143C 1833 nt7.37□□□□□ -1.23
PBP1P53297 MPC1YGL080W 393 nt7.37□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YHR145CYHR145C 357 nt7.37□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YOR343CYOR343C 327 nt7.37□□□□□ -1.23
PBP1P53297 DPL1YDR294C 1770 nt7.37□□□□□ -1.23
PBP1P53297 INH1YDL181W 258 nt7.36□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YFR020WYFR020W 699 nt7.36□□□□□ -1.23
PBP1P53297 TAF4YMR005W 1167 nt7.36□□□□□ -1.23
PBP1P53297 ADE16YLR028C 1776 nt7.36□□□□□ -1.23
PBP1P53297 GRH1YDR517W 1119 nt7.35□□□□□ -1.23
PBP1P53297 TIF2YJL138C 1188 nt7.35□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YJL160CYJL160C 864 nt7.35□□□□□ -1.23
PBP1P53297 TIF1YKR059W 1188 nt7.35□□□□□ -1.23
PBP1P53297 AIM34YMR003W 597 nt7.35□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YPR150WYPR150W 522 nt7.35□□□□□ -1.23
PBP1P53297 YDR401WYDR401W 564 nt7.34□□□□□ -1.23
PBP1P53297 HRA1HRA1 564 nt7.34□□□□□ -1.23
PBP1P53297 PET18YCR020C 648 nt7.33□□□□□ -1.24
PBP1P53297 RPL12BYDR418W 498 nt7.33□□□□□ -1.24
PBP1P53297 MMS21YEL019C 804 nt7.33□□□□□ -1.24
PBP1P53297 EMC3YKL207W 762 nt7.33□□□□□ -1.24
PBP1P53297 KGD2YDR148C 1392 nt7.33□□□□□ -1.24
PBP1P53297 RSM7YJR113C 744 nt7.32□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YML079WYML079W 606 nt7.32□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YNL234WYNL234W 1281 nt7.32□□□□□ -1.24
PBP1P53297 CCR4YAL021C 2514 nt7.32□□□□□ -1.24
PBP1P53297 ATG23YLR431C 1362 nt7.32□□□□□ -1.24
PBP1P53297 BUD31YCR063W 474 nt7.31□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.31□□□□□ -1.24
PBP1P53297 SLD7YOR060C 774 nt7.31□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YPL168WYPL168W 1293 nt7.31□□□□□ -1.24
PBP1P53297 ENP1YBR247C 1452 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 FET5YFL041W 1869 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 AI3Q0060 1248 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YMR166CYMR166C 1107 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 HST2YPL015C 1074 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 COA2YPL189C-A 207 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 MRI1YPR118W 1236 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 GAS1YMR307W 1680 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YMR210WYMR210W 1350 nt7.3□□□□□ -1.24
PBP1P53297 PTC6YCR079W 1329 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 SBP1YHL034C 885 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 ORT1YOR130C 879 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 ATP4YPL078C 735 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 PFS2YNL317W 1398 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 YEN1YER041W 2280 nt7.29□□□□□ -1.24
PBP1P53297 TOP3YLR234W 1971 nt7.28□□□□□ -1.24
PBP1P53297 SUA5YGL169W 1281 nt7.28□□□□□ -1.24
PBP1P53297 LSP1YPL004C 1026 nt7.28□□□□□ -1.24
PBP1P53297 LEU4YNL104C 1860 nt7.28□□□□□ -1.24
PBP1P53297 CHS5YLR330W 2016 nt7.27□□□□□ -1.25
PBP1P53297 MRP1YDR347W 966 nt7.27□□□□□ -1.25
PBP1P53297 CWC25YNL245C 540 nt7.27□□□□□ -1.25
PBP1P53297 snR4snR4 186 nt7.27□□□□□ -1.25
PBP1P53297 YIL108WYIL108W 2091 nt7.27□□□□□ -1.25
PBP1P53297 REV7YIL139C 738 nt7.26□□□□□ -1.25
PBP1P53297 YLR460CYLR460C 1131 nt7.26□□□□□ -1.25
PBP1P53297 SPS22YCL048W 1392 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 COS6YGR295C 1146 nt7.25□□□□□ -1.25
PBP1P53297 ATP10YLR393W 840 nt7.25□□□□□ -1.25
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