Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2A1P52655 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A1P52655 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A1P52655 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2A1P52655 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A1P52655 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A1P52655 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms