Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KNTC1P50748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KNTC1P50748 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNTC1P50748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNTC1P50748 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms