Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ME1P48163 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ME1P48163 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ME1P48163 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ME1P48163 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ME1P48163 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ME1P48163 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME1P48163 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME1P48163 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME1P48163 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME1P48163 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME1P48163 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ME1P48163 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ME1P48163 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ME1P48163 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ME1P48163 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ME1P48163 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ME1P48163 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME1P48163 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME1P48163 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME1P48163 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ME1P48163 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME1P48163 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME1P48163 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ME1P48163 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME1P48163 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ME1P48163 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME1P48163 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME1P48163 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ME1P48163 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ME1P48163 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ME1P48163 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME1P48163 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME1P48163 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME1P48163 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ME1P48163 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ME1P48163 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ME1P48163 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ME1P48163 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ME1P48163 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME1P48163 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ME1P48163 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME1P48163 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME1P48163 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ME1P48163 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ME1P48163 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ME1P48163 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ME1P48163 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ME1P48163 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ME1P48163 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME1P48163 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME1P48163 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME1P48163 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME1P48163 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ME1P48163 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ME1P48163 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ME1P48163 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ME1P48163 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ME1P48163 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ME1P48163 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ME1P48163 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ME1P48163 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ME1P48163 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ME1P48163 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ME1P48163 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ME1P48163 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ME1P48163 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ME1P48163 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ME1P48163 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ME1P48163 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ME1P48163 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ME1P48163 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ME1P48163 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ME1P48163 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ME1P48163 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ME1P48163 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ME1P48163 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ME1P48163 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ME1P48163 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ME1P48163 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ME1P48163 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ME1P48163 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ME1P48163 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ME1P48163 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ME1P48163 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ME1P48163 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ME1P48163 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms