Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA4P48058 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA4P48058 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA4P48058 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA4P48058 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms