Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT9P35527 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT9P35527 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT9P35527 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT9P35527 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT9P35527 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT9P35527 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT9P35527 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT9P35527 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT9P35527 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT9P35527 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT9P35527 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT9P35527 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT9P35527 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT9P35527 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT9P35527 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT9P35527 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT9P35527 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT9P35527 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT9P35527 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT9P35527 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT9P35527 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT9P35527 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT9P35527 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT9P35527 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT9P35527 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT9P35527 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT9P35527 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT9P35527 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT9P35527 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT9P35527 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT9P35527 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT9P35527 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT9P35527 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT9P35527 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT9P35527 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT9P35527 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT9P35527 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT9P35527 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT9P35527 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT9P35527 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT9P35527 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT9P35527 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT9P35527 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT9P35527 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT9P35527 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT9P35527 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT9P35527 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT9P35527 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT9P35527 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT9P35527 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT9P35527 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT9P35527 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT9P35527 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT9P35527 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT9P35527 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT9P35527 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT9P35527 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT9P35527 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT9P35527 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT9P35527 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT9P35527 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT9P35527 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT9P35527 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT9P35527 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT9P35527 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT9P35527 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT9P35527 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT9P35527 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT9P35527 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT9P35527 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT9P35527 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT9P35527 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT9P35527 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT9P35527 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT9P35527 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT9P35527 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT9P35527 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT9P35527 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT9P35527 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT9P35527 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT9P35527 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT9P35527 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT9P35527 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT9P35527 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT9P35527 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT9P35527 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT9P35527 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT9P35527 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT9P35527 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT9P35527 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT9P35527 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT9P35527 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT9P35527 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT9P35527 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT9P35527 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT9P35527 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT9P35527 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT9P35527 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT9P35527 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms