Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRBP23467 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRBP23467 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRBP23467 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRBP23467 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
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