Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT1P21579 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT1P21579 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT1P21579 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT1P21579 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT1P21579 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYT1P21579 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYT1P21579 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYT1P21579 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYT1P21579 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYT1P21579 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT1P21579 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYT1P21579 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYT1P21579 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYT1P21579 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYT1P21579 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT1P21579 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT1P21579 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT1P21579 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT1P21579 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT1P21579 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYT1P21579 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYT1P21579 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYT1P21579 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYT1P21579 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYT1P21579 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYT1P21579 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYT1P21579 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYT1P21579 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYT1P21579 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYT1P21579 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYT1P21579 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYT1P21579 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYT1P21579 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYT1P21579 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT1P21579 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT1P21579 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT1P21579 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYT1P21579 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYT1P21579 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYT1P21579 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYT1P21579 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYT1P21579 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYT1P21579 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYT1P21579 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYT1P21579 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYT1P21579 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT1P21579 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT1P21579 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT1P21579 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT1P21579 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT1P21579 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT1P21579 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT1P21579 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT1P21579 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT1P21579 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT1P21579 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT1P21579 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT1P21579 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT1P21579 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT1P21579 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT1P21579 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT1P21579 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT1P21579 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT1P21579 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYT1P21579 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYT1P21579 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYT1P21579 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYT1P21579 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYT1P21579 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT1P21579 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT1P21579 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYT1P21579 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT1P21579 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT1P21579 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT1P21579 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT1P21579 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT1P21579 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT1P21579 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT1P21579 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT1P21579 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT1P21579 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT1P21579 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYT1P21579 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYT1P21579 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYT1P21579 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYT1P21579 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYT1P21579 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT1P21579 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT1P21579 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT1P21579 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT1P21579 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYT1P21579 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYT1P21579 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms