Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ATF3P18847 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATF3P18847 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATF3P18847 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATF3P18847 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATF3P18847 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATF3P18847 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATF3P18847 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATF3P18847 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATF3P18847 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ATF3P18847 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATF3P18847 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ATF3P18847 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATF3P18847 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATF3P18847 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATF3P18847 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ATF3P18847 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF3P18847 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF3P18847 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF3P18847 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATF3P18847 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ATF3P18847 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ATF3P18847 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATF3P18847 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATF3P18847 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATF3P18847 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATF3P18847 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ATF3P18847 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATF3P18847 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATF3P18847 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATF3P18847 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ATF3P18847 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATF3P18847 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATF3P18847 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATF3P18847 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ATF3P18847 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATF3P18847 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATF3P18847 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATF3P18847 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATF3P18847 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATF3P18847 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ATF3P18847 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ATF3P18847 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATF3P18847 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATF3P18847 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATF3P18847 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATF3P18847 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATF3P18847 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATF3P18847 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATF3P18847 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
ATF3P18847 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATF3P18847 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATF3P18847 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF3P18847 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF3P18847 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF3P18847 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF3P18847 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ATF3P18847 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF3P18847 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF3P18847 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF3P18847 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF3P18847 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF3P18847 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ATF3P18847 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ATF3P18847 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ATF3P18847 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ATF3P18847 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATF3P18847 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATF3P18847 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATF3P18847 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATF3P18847 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATF3P18847 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATF3P18847 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATF3P18847 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATF3P18847 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATF3P18847 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATF3P18847 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATF3P18847 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATF3P18847 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATF3P18847 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATF3P18847 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATF3P18847 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATF3P18847 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATF3P18847 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATF3P18847 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATF3P18847 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATF3P18847 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATF3P18847 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATF3P18847 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATF3P18847 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATF3P18847 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATF3P18847 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATF3P18847 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms