Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDP15428 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDP15428 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDP15428 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDP15428 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPGDP15428 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPGDP15428 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPGDP15428 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPGDP15428 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPGDP15428 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPGDP15428 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDP15428 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDP15428 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDP15428 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPGDP15428 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDP15428 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPGDP15428 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPGDP15428 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDP15428 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDP15428 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDP15428 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDP15428 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPGDP15428 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPGDP15428 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPGDP15428 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPGDP15428 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HPGDP15428 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPGDP15428 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPGDP15428 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPGDP15428 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPGDP15428 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPGDP15428 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPGDP15428 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPGDP15428 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPGDP15428 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPGDP15428 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPGDP15428 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPGDP15428 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPGDP15428 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPGDP15428 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HPGDP15428 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPGDP15428 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPGDP15428 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPGDP15428 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPGDP15428 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HPGDP15428 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPGDP15428 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPGDP15428 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPGDP15428 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPGDP15428 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPGDP15428 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPGDP15428 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPGDP15428 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPGDP15428 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPGDP15428 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPGDP15428 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPGDP15428 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPGDP15428 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPGDP15428 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPGDP15428 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPGDP15428 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPGDP15428 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDP15428 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPGDP15428 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPGDP15428 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPGDP15428 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms