Protein–RNA interactions for Protein: P15313

ATP6V1B1, V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B1P15313 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1B1P15313 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B1P15313 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1B1P15313 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B1P15313 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms