Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR23D2P0DMB1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23D2P0DMB1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR23D2P0DMB1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms