Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC4LP0CB38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC4LP0CB38 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PABPC4LP0CB38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC4LP0CB38 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms