Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTAP01040 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTAP01040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTAP01040 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTAP01040 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTAP01040 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTAP01040 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTAP01040 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTAP01040 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTAP01040 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTAP01040 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTAP01040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTAP01040 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTAP01040 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTAP01040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTAP01040 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTAP01040 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTAP01040 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTAP01040 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTAP01040 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTAP01040 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTAP01040 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTAP01040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTAP01040 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTAP01040 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTAP01040 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTAP01040 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTAP01040 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTAP01040 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTAP01040 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTAP01040 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTAP01040 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTAP01040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTAP01040 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTAP01040 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTAP01040 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTAP01040 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTAP01040 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTAP01040 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTAP01040 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTAP01040 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTAP01040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTAP01040 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTAP01040 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTAP01040 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTAP01040 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTAP01040 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTAP01040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTAP01040 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTAP01040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTAP01040 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTAP01040 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTAP01040 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTAP01040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTAP01040 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTAP01040 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTAP01040 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTAP01040 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms