Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BANF1O75531 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BANF1O75531 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BANF1O75531 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BANF1O75531 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BANF1O75531 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BANF1O75531 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BANF1O75531 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BANF1O75531 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BANF1O75531 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BANF1O75531 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BANF1O75531 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BANF1O75531 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BANF1O75531 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BANF1O75531 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BANF1O75531 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BANF1O75531 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BANF1O75531 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BANF1O75531 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BANF1O75531 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BANF1O75531 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BANF1O75531 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BANF1O75531 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BANF1O75531 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BANF1O75531 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BANF1O75531 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BANF1O75531 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BANF1O75531 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BANF1O75531 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BANF1O75531 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BANF1O75531 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BANF1O75531 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BANF1O75531 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BANF1O75531 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BANF1O75531 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BANF1O75531 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BANF1O75531 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BANF1O75531 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BANF1O75531 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BANF1O75531 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BANF1O75531 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BANF1O75531 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BANF1O75531 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BANF1O75531 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BANF1O75531 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BANF1O75531 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BANF1O75531 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BANF1O75531 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BANF1O75531 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BANF1O75531 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BANF1O75531 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BANF1O75531 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BANF1O75531 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BANF1O75531 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BANF1O75531 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BANF1O75531 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BANF1O75531 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BANF1O75531 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BANF1O75531 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BANF1O75531 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BANF1O75531 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BANF1O75531 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BANF1O75531 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BANF1O75531 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BANF1O75531 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BANF1O75531 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BANF1O75531 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BANF1O75531 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BANF1O75531 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BANF1O75531 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BANF1O75531 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BANF1O75531 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BANF1O75531 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BANF1O75531 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BANF1O75531 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BANF1O75531 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BANF1O75531 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BANF1O75531 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BANF1O75531 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BANF1O75531 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BANF1O75531 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms