Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC22BO75396 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC22BO75396 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC22BO75396 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC22BO75396 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms