Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUTAO60888 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUTAO60888 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CUTAO60888 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUTAO60888 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUTAO60888 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUTAO60888 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUTAO60888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUTAO60888 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUTAO60888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUTAO60888 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUTAO60888 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUTAO60888 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUTAO60888 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUTAO60888 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUTAO60888 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUTAO60888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUTAO60888 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUTAO60888 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUTAO60888 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUTAO60888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUTAO60888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUTAO60888 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUTAO60888 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUTAO60888 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUTAO60888 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CUTAO60888 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUTAO60888 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUTAO60888 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUTAO60888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUTAO60888 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUTAO60888 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUTAO60888 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUTAO60888 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUTAO60888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUTAO60888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUTAO60888 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUTAO60888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUTAO60888 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUTAO60888 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUTAO60888 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUTAO60888 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUTAO60888 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUTAO60888 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUTAO60888 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUTAO60888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUTAO60888 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUTAO60888 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUTAO60888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUTAO60888 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUTAO60888 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUTAO60888 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUTAO60888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUTAO60888 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUTAO60888 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUTAO60888 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUTAO60888 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUTAO60888 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUTAO60888 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUTAO60888 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUTAO60888 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUTAO60888 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUTAO60888 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUTAO60888 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUTAO60888 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUTAO60888 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUTAO60888 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUTAO60888 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUTAO60888 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUTAO60888 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUTAO60888 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUTAO60888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUTAO60888 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUTAO60888 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUTAO60888 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUTAO60888 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUTAO60888 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUTAO60888 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUTAO60888 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUTAO60888 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUTAO60888 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUTAO60888 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUTAO60888 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUTAO60888 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUTAO60888 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUTAO60888 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUTAO60888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUTAO60888 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUTAO60888 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUTAO60888 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUTAO60888 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUTAO60888 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUTAO60888 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms