Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TM4SF5O14894 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TM4SF5O14894 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TM4SF5O14894 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF5O14894 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF5O14894 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.6 ms