Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BCKDKO14874 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BCKDKO14874 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms