Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAFD1O14545 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAFD1O14545 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAFD1O14545 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAFD1O14545 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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