Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD12O00232 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD12O00232 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD12O00232 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD12O00232 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD12O00232 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms