Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX2-CTNND1H3BSU7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms