Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRRM5B3KS81 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM5B3KS81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM5B3KS81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms