Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XIRP2A4UGR9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
XIRP2A4UGR9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XIRP2A4UGR9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms