Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A4D1N5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A4D1N5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4D1N5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4D1N5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4D1N5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4D1N5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4D1N5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4D1N5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4D1N5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4D1N5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4D1N5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4D1N5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4D1N5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4D1N5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4D1N5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4D1N5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4D1N5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4D1N5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4D1N5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4D1N5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4D1N5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4D1N5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4D1N5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4D1N5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4D1N5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4D1N5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4D1N5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4D1N5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4D1N5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4D1N5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4D1N5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4D1N5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4D1N5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4D1N5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4D1N5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4D1N5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4D1N5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4D1N5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4D1N5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4D1N5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4D1N5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4D1N5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4D1N5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4D1N5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A4D1N5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A4D1N5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4D1N5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4D1N5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4D1N5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4D1N5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4D1N5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4D1N5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A4D1N5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A4D1N5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms