Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PFDN5Q99471 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms