Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TK1P04183 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TK1P04183 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TK1P04183 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TK1P04183 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TK1P04183 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TK1P04183 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms