Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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