Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CGGBP1Q9UFW8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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