Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI08

NCOA7, Nuclear receptor coactivator 7, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA7Q8NI08 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCOA7Q8NI08 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms