Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID3CA6NKF2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID3CA6NKF2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms