Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR53Q7Z5U6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms