Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRMT12Q53H54 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms