Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN5Q99471 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms