Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRYD3Q8NCJ5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRYD3Q8NCJ5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms