Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3C1V9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3C1V9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3C1V9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms