Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HIF1AQ16665 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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HIF1AQ16665 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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HIF1AQ16665 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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HIF1AQ16665 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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HIF1AQ16665 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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HIF1AQ16665 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HIF1AQ16665 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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