Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPB1P53618 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPB1P53618 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPB1P53618 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPB1P53618 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 744.9 ms