RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542739.2

CXorf49B-202, Transcript of chromosome X open reading frame 49B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf49B, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf49B-202ENST00000542739 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.11■■■■■ 4.81
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CXorf49B-202ENST00000542739 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.29■■■■□ 3.56
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CXorf49B-202ENST00000542739 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.96■■■■□ 3.35
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CXorf49B-202ENST00000542739 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.84■■■■□ 3.17
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CXorf49B-202ENST00000542739 SMARCA4P51532 1647 aa34.76■■■■□ 3.16
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CXorf49B-202ENST00000542739 WIZO95785 1651 aa34.51■■■■□ 3.12
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CXorf49B-202ENST00000542739 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.32■■■■□ 3.08
CXorf49B-202ENST00000542739 SMARCA2P51531 1590 aa34.27■■■■□ 3.08
CXorf49B-202ENST00000542739 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.2■■■■□ 3.07
CXorf49B-202ENST00000542739 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
CXorf49B-202ENST00000542739 NCAPD3P42695 1498 aa34.11■■■■□ 3.05
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CXorf49B-202ENST00000542739 NESP48681 1621 aa33.07■■■□□ 2.88
CXorf49B-202ENST00000542739 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33■■■□□ 2.87
CXorf49B-202ENST00000542739 PRDM2Q13029 1718 aa32.97■■■□□ 2.87
CXorf49B-202ENST00000542739 ABCC8Q09428 1581 aa32.93■■■□□ 2.86
CXorf49B-202ENST00000542739 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.82■■■□□ 2.84
CXorf49B-202ENST00000542739 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.78■■■□□ 2.84
CXorf49B-202ENST00000542739 TRIM41Q8WV44 630 aa32.77■■■□□ 2.84
CXorf49B-202ENST00000542739 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.76■■■□□ 2.84
CXorf49B-202ENST00000542739 SYNJ1O43426 1573 aa32.66■■■□□ 2.82
CXorf49B-202ENST00000542739 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.65■■■□□ 2.82
CXorf49B-202ENST00000542739 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.63■■■□□ 2.81
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CXorf49B-202ENST00000542739 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.52■■■□□ 2.8
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CXorf49B-202ENST00000542739 WDR97A6NE52 1622 aa31.94■■■□□ 2.7
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CXorf49B-202ENST00000542739 IFT140Q96RY7 1462 aa31.9■■■□□ 2.7
CXorf49B-202ENST00000542739 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
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CXorf49B-202ENST00000542739 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.39■■■□□ 2.62
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CXorf49B-202ENST00000542739 SYNJ2O15056 1496 aa31.24■■■□□ 2.59
CXorf49B-202ENST00000542739 CEP162Q5TB80 1403 aa31.2■■■□□ 2.59
CXorf49B-202ENST00000542739 GRIN2AQ12879 1464 aa31.19■■■□□ 2.58
CXorf49B-202ENST00000542739 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CXorf49B-202ENST00000542739 FBLN2P98095 1184 aa31.14■■■□□ 2.58
CXorf49B-202ENST00000542739 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.09■■■□□ 2.57
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