Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms