Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms