Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms